文部科学省は公立小中高校で土曜授業を行いやすくするため、11月29日、学校教育法施行規則（省令）を改正し、施行した。これまで土曜授業の実施を「特別の必要がある場合」に限っていたが、「教育委員会が必要と認める場合」に改め、教育委員会の判断で実施しやすくした。

東京都は新年度予算案に調査研究費1000万円を計上して、公立の小中高校一貫校の創設に向けて検討を始める。受験に中断されずに12年間の一貫した教育で新たな人材育成を目指す。私学では早稲田実業学校（国分寺市）や2013年４月開設予定の慶應義塾横浜初等部（横浜市）などがある。また長崎県などで市立小中学校と高校が連携している例はあるが、都道府県立にはない。

文部科学省は４月に小６と中３を対象に実施した全国学力調査の結果を公表した。国語、算数・数学、理科の３教科について全小中学校の３割を抽出して行われた。今回初めて加わった理科で、観察・実験の結果を考察する問題の正答率が低かった。同じ傾向は小６、中３の全教科で見られ、応用や記述が苦手な傾向は変わっていない。また、アンケートの「理科の勉強が好き」の回答について、小６は82％、中３は62％、「よく分かる」の回答では、小６では理科が３教科で最多の86％に対し、中３では最低の65％と、中学生になると「理科離れ」が進んでいた。